11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3387 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0566  hypothetical protein  97.09 
 
 		 172 aa  333  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3557  hypothetical protein  95.35 
 
 		 172 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000307  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  30.36 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  25.15 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  39.68 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2990  hypothetical protein  35.14 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  29.41 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  25.95 
 
 		 173 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  23.75 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>