23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4533 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  53.55 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  41.1 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  41.14 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  32.81 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  38.26 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  32.81 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  32.43 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  31.45 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  37.34 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  30.52 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  28.21 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  30.38 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000307  hypothetical protein  33.75 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  33.01 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  26.71 
 
 		 238 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  35.62 
 
 		 157 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  30.33 
 
 		 179 aa  40.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0566  hypothetical protein  30.43 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  30.95 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>