37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3115 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  43.97 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  32.71 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  37.95 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  31.85 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  31.97 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  32.17 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  31.13 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  37.04 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  33.07 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  38.06 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  30.95 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  36.79 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  31.51 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  35.64 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  31 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  30.94 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  35.33 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  33.54 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  34.31 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  32.35 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  32.17 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  28.65 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  29.24 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  28.31 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  31.53 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  32.43 
 
 		 206 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  25.15 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  29.73 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  31.9 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  26.32 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  35.45 
 
 		 197 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  25.25 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  26.7 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>