24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3712 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  323  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  97.56 
 
 		 164 aa  320  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  98.17 
 
 		 164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  93.9 
 
 		 164 aa  276  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  79.88 
 
 		 164 aa  265  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  77.58 
 
 		 165 aa  259  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  81.1 
 
 		 164 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  69.51 
 
 		 164 aa  190  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  69.51 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  68.9 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18810  hypothetical protein  65.62 
 
 		 169 aa  163  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000270123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  36.22 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  27.27 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  27.44 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  30.25 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  31.82 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  26.67 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  26.25 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  30.3 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  26.38 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  29.27 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  26.19 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  31.85 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>