47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3084 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  33.77 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  35.57 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02346  hypothetical protein  35.67 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  33.83 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  37.76 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  36.18 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  29.88 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  34.81 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  40.46 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  30.99 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0864  hypothetical protein  37.01 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.091586  normal  0.0546171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  28.67 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  38.66 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  37.61 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0824  hypothetical protein  36.22 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  38.53 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  33.56 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  34.95 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  38.53 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  28.66 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  38.36 
 
 		 197 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  32.45 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  38.36 
 
 		 197 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  34.48 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  39.02 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0851  hypothetical protein  37.82 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  37.67 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  41.94 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  35.45 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  29.77 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  38.32 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  33.04 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1734  hypothetical protein  26.76 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.711828 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  32.76 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  34.26 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2470  hypothetical protein  36.69 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.880141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  34.58 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  34.58 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  26.61 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  27.55 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>