33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1404 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  95.43 
 
 		 197 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  91.88 
 
 		 197 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  75.63 
 
 		 197 aa  270  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  55.5 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  57.29 
 
 		 212 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  54.15 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  54.63 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  53.81 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  44.65 
 
 		 182 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  41.76 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  43.02 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  39.18 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  41.67 
 
 		 170 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  40.17 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  40.18 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  40.54 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  35.43 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  31.29 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  33.07 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  37.65 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  33.96 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  25.14 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  36.99 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  32.8 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  31.3 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  29.11 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  31.74 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  33.06 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>