32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1457 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  387  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  92.89 
 
 
197 aa  337  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  91.88 
 
 
197 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  75.63 
 
 
197 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  55.5 
 
 
206 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  56.78 
 
 
212 aa  207  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  54.63 
 
 
218 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  54.15 
 
 
218 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  54.31 
 
 
187 aa  197  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  45.51 
 
 
182 aa  131  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  43.79 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  39.05 
 
 
175 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  40.97 
 
 
170 aa  104  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  44.22 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  39.32 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  40.54 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  40.54 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  31.97 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  38.53 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  35.78 
 
 
158 aa  61.6  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  37.65 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  26.82 
 
 
200 aa  58.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  33.02 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  39.62 
 
 
162 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  36.3 
 
 
158 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  32.06 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  30.47 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  32.93 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  32.64 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>