23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0525 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  31.85 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  34.44 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  32.96 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  33.12 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  28.1 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  30.41 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  28.12 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  29.21 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  28.67 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  27.86 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  30.89 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  28.12 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  29.03 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  33.02 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  27.72 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  28.1 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  29.87 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  26.72 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  25.75 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  28.93 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  30.08 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>