31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001270 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  76.58 
 
 		 158 aa  256  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  52.32 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  31.85 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  31.69 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  30.17 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  35.35 
 
 		 222 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  28.76 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  28.76 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  37.01 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  30.61 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  32.76 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  33.65 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  35.43 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  39.45 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  38.53 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  28.29 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  33.94 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  38.39 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  33.94 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  33.94 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  30.28 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  31.4 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  31.78 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  29.06 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  29.7 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02346  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  26.58 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  45.45 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>