33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2784 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  95.87 
 
 
218 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  91.28 
 
 
212 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  90.37 
 
 
206 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  73.3 
 
 
187 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  54.63 
 
 
197 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  54.15 
 
 
197 aa  191  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  54.15 
 
 
197 aa  188  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  53.66 
 
 
197 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  43.21 
 
 
182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  42.28 
 
 
170 aa  118  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  42.86 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  41.61 
 
 
171 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  37.42 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  44.59 
 
 
164 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  35.51 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  34.82 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  34.75 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  35.59 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  33.77 
 
 
179 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  39.09 
 
 
158 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  31.4 
 
 
167 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  27.92 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  29.87 
 
 
155 aa  55.1  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  33.94 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  29.66 
 
 
164 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  33.94 
 
 
162 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  29.03 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  26.72 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  32.54 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  27.59 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  38.53 
 
 
158 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>