43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5139 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  344  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  38.95 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  42.5 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  41.14 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  32.08 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  31.87 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  34.36 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  38.79 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  38.58 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  32.48 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  30.26 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  32.08 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  32.11 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  32.91 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  33.06 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  32.54 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  32.28 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  31.45 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  30.82 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  32.81 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000307  hypothetical protein  48.33 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  34.48 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  26.54 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  31.16 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3056  alpha-2 type XI collagen  35.76 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  30.94 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  26.32 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  43.36 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  32.79 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0566  hypothetical protein  38.67 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3557  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  32.43 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  24.6 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1734  hypothetical protein  31.68 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.711828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  31.2 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  29.81 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3387  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  31.53 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2990  hypothetical protein  34.88 
 
 		 228 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>