26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2137 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  100 
 
 		 170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  38.69 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  36.65 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  38.1 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  38.26 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  30.25 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  32.1 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  33.64 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  40.46 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3056  alpha-2 type XI collagen  36.75 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  31.71 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  31.52 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  38.71 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  32.17 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  30.25 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  30.25 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  30.25 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  30.25 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  29.41 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  31.4 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  27.04 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000307  hypothetical protein  28.24 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1734  hypothetical protein  22.83 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.899123  normal  0.711828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>