34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3092 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  75.63 
 
 		 197 aa  273  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  76.14 
 
 		 197 aa  273  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  75.63 
 
 		 197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  56.78 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  55.12 
 
 		 218 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  58.42 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  53.66 
 
 		 218 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  52.79 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  47.8 
 
 		 182 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  43.64 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  44.38 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  45.83 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  40.27 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  45.14 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  41.88 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  37.38 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  37.38 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  37.8 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  37.01 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  39.07 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  33.96 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  27.92 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  41.51 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  32.34 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  32.06 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  31.16 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  35.34 
 
 		 155 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  40.19 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  30.83 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  31.97 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  31.54 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>