41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2171 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  37.43 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  32.93 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  35.71 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  34.42 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  35.06 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  37.75 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  32.3 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  34.42 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  34.21 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  29.94 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  33.11 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  31.37 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  37.87 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  30.99 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  31.82 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  34.21 
 
 		 161 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  31.82 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  38.79 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  31.71 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  32.89 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  39.09 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  34.64 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  32.32 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  28.29 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  32.68 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  32.32 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  29.61 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  38.84 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  30.25 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  31.52 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  29.01 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  28.05 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  29.27 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0851  hypothetical protein  38.05 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>