25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3210 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  332  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  80 
 
 		 164 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  77.58 
 
 		 164 aa  267  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  80.61 
 
 		 164 aa  259  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  77.58 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  76.97 
 
 		 164 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  78.79 
 
 		 164 aa  239  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  65.45 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  64.85 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  64.85 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18810  hypothetical protein  71.3 
 
 		 169 aa  167  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000270123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  26.63 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  33.06 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  30.98 
 
 		 238 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  30.65 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  29.45 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  25.15 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  28.47 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  25.15 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  28.47 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  28.47 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  26.95 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  26.04 
 
 		 173 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>