27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1562 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  97.56 
 
 		 164 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  96.95 
 
 		 164 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  93.9 
 
 		 164 aa  277  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  79.27 
 
 		 164 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  77.58 
 
 		 165 aa  260  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  79.27 
 
 		 164 aa  255  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  68.9 
 
 		 164 aa  190  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  69.51 
 
 		 164 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  68.9 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18810  hypothetical protein  65.62 
 
 		 169 aa  164  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000270123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  27.88 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  35.43 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  26.83 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  31.17 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  30.83 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  28.1 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  26.06 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  29.88 
 
 		 175 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  29.7 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  25.77 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  25.6 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  31.21 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  27.59 
 
 		 218 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  27.59 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  28.28 
 
 		 212 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>