11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0851 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0851  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  383  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223222  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  30.06 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  30.06 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  36.88 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  34.45 
 
 
155 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  28.31 
 
 
165 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  27.95 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  30.49 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  28.99 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  36.28 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>