26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3761 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  328  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  93.9 
 
 		 164 aa  297  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  80 
 
 		 165 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  79.27 
 
 		 164 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  79.88 
 
 		 164 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  79.27 
 
 		 164 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  80.49 
 
 		 164 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  69.51 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  68.9 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  67.07 
 
 		 164 aa  187  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18810  hypothetical protein  66.41 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000270123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  27.88 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  33.07 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  27.44 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  26.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  26.54 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  31.21 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  29.66 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  29.66 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  30.34 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  27.12 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  29.66 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  27.89 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  27.59 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>