37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2680 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  59.46 
 
 		 169 aa  174  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  46.25 
 
 		 212 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  45.64 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  43.21 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  42.07 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  39.18 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  49.32 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  46.2 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  45.51 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  46.98 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  39.88 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  35.98 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  32.14 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  38.24 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  38.04 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  36.61 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  32.41 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  29.38 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  29.56 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  29.8 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  31.76 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  35.92 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  33.94 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  32.35 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  30.83 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  29.84 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  29.7 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  28.21 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  28.93 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  25.75 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>