28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2889 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  352  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  52.53 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  42.5 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  40.57 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  38.1 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  29.61 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  32.95 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  29.61 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  30.4 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  31.53 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000307  hypothetical protein  30.71 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  33.6 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  30.89 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0566  hypothetical protein  27.17 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  30.46 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3387  hypothetical protein  29.35 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.493947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  36.53 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3557  hypothetical protein  28.8 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  31.01 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  26.62 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  33.04 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3056  alpha-2 type XI collagen  39.22 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  36.13 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  27.08 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  27.34 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>