26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1745 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  29.82 
 
 		 161 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  29.76 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  33.72 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  30.67 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  31.17 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  30.06 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  29.79 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  31.43 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  32.33 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  32.52 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  30.37 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  29.82 
 
 		 175 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  30.4 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  29.35 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  30.83 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  27.7 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  30.52 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  30.52 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  26.5 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  27.59 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  34.25 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  28.46 
 
 		 168 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>