21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18810  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  333  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000270123  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  63.1 
 
 
164 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  63.69 
 
 
164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  61.54 
 
 
165 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  63.69 
 
 
164 aa  190  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  63.1 
 
 
164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  65.27 
 
 
164 aa  187  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  64.29 
 
 
164 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  63.1 
 
 
164 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  65.27 
 
 
164 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  64.67 
 
 
164 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  36.72 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  32.56 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  26.04 
 
 
161 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  34.55 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  32.81 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  25.44 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  31.2 
 
 
182 aa  44.3  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  25.31 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  26.51 
 
 
222 aa  41.2  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  26.92 
 
 
238 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>