23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24410 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  315  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  99.39 
 
 		 164 aa  315  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  68.9 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  69.51 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  65.45 
 
 		 165 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  69.51 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  68.9 
 
 		 164 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  68.29 
 
 		 164 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  68.29 
 
 		 164 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  71.34 
 
 		 164 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18810  hypothetical protein  68.75 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000270123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  26.83 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  34.92 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  26.79 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  26.51 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  24.85 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  28.02 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  35.51 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  33.87 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  27.05 
 
 		 168 aa  42  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  27.97 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  34.4 
 
 		 212 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>