17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2931 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2931  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  324  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  70.3 
 
 		 164 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2030  hypothetical protein  71.52 
 
 		 164 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  70.91 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3761  hypothetical protein  67.07 
 
 		 164 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3210  hypothetical protein  64.85 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  67.68 
 
 		 164 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1590  hypothetical protein  70.91 
 
 		 164 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125319  hitchhiker  0.0000367551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2068  hypothetical protein  71.95 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24410  hypothetical protein  71.34 
 
 		 164 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18810  hypothetical protein  73.39 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000270123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  26.67 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  29.1 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  28.97 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  30.65 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  36.45 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>