20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0052 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1290  hypothetical protein  41.07 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0187  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704355  normal  0.309268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1312  hypothetical protein  35.35 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00893975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3109  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5059  hypothetical protein  30.63 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0934  hypothetical protein  32.29 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0132  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633937  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2825  hypothetical protein  36.08 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712693  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0964  hypothetical protein  32.29 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1807  hypothetical protein  34.44 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3059  hypothetical protein  35.8 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1216  hypothetical protein  30.43 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0303  hypothetical protein  34.21 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2776  hypothetical protein  33.04 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0395  hypothetical protein  26.6 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3767  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1078  hypothetical protein  35.4 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0435  hypothetical protein  34.33 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.425168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>