125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0297 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  61.62 
 
 
199 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  59.69 
 
 
223 aa  254  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  58.08 
 
 
201 aa  248  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  58.08 
 
 
201 aa  246  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  54.77 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  55.05 
 
 
201 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  50.25 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  52 
 
 
217 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 
199 aa  207  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  50.75 
 
 
201 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  50.77 
 
 
198 aa  197  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  47.26 
 
 
202 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  47.26 
 
 
202 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  46.27 
 
 
202 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
200 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  43.88 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 
200 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  44.1 
 
 
200 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
199 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 
200 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  47.67 
 
 
233 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 
200 aa  165  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 
202 aa  162  3e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  41.03 
 
 
197 aa  158  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 
201 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
199 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 
201 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
201 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 
208 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 
207 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  44.21 
 
 
198 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
202 aa  121  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  29.19 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
237 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  24.82 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.65 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  26.36 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.52 
 
 
274 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  26.15 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 
282 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  25.9 
 
 
245 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
258 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  27.39 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  27.39 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  21.74 
 
 
234 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
252 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  24.04 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 
256 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 
256 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 
256 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.63 
 
 
293 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.15 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  24.59 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  25.46 
 
 
230 aa  48.5  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  27.82 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.09 
 
 
233 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0994645  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  27.82 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  22.22 
 
 
232 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.6 
 
 
259 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2598  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.34 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5308  dehydrogenase  30.43 
 
 
256 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  27.27 
 
 
286 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  24.73 
 
 
252 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.12 
 
 
251 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  24.73 
 
 
252 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
248 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
248 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
248 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3240  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
264 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.538223  normal  0.0864217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  24.65 
 
 
266 aa  44.7  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0450  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 
274 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
284 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.26 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.96 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.53 
 
 
257 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1566  short chain dehydrogenase  25 
 
 
267 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  24.29 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.62 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.61 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  25.4 
 
 
318 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 
261 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.63 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.9 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.63 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.9 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.63 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.98 
 
 
243 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  22.83 
 
 
251 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>