More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0181 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0181  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00299  SMF protein  53.74 
 
 		 295 aa  311  7.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0738024  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0829  SMF protein  51.6 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000000494778  unclonable  0.00000053087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2199  SMF protein  48.75 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000109566  n/a   
 
 
 
NC_009667  Oant_0895  SMF family protein  51.69 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0725141  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4391  SMF family protein  46.32 
 
 		 226 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  37.75 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  35.19 
 
 		 394 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  34.75 
 
 		 364 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  33.79 
 
 		 349 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  34.18 
 
 		 360 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 365 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  38.94 
 
 		 365 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 		 362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  35.06 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.56 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  36.79 
 
 		 371 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.54 
 
 		 366 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  36.53 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  32.28 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  35.27 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  35.61 
 
 		 388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  36.32 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  37.56 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  35.27 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 372 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.61 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 		 359 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  37.44 
 
 		 370 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.56 
 
 		 361 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.02 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.05 
 
 		 373 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  34.27 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.54 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  29.3 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  34.6 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 359 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.71 
 
 		 401 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 359 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  37.02 
 
 		 379 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  35.27 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.06 
 
 		 362 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  34.65 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  32.73 
 
 		 399 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5585  SMF family protein  39.44 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  39.25 
 
 		 402 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  39.71 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.34 
 
 		 406 aa  122  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  36.21 
 
 		 388 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  35.58 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.09 
 
 		 365 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  35.58 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  34.12 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  37.68 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.68 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  36.28 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  35.9 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  35.12 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  34.45 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 369 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.99 
 
 		 362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  34.93 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  35.12 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  34.63 
 
 		 368 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  35.61 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  31.91 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  34.95 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.56 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  32.42 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 366 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  36.71 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  32.47 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 364 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 422 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  36.23 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  39.63 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  32.93 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  34.62 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  35.89 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>