More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2414 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2414  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  858    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2512  major facilitator transporter  99.54 
 
 		 434 aa  852    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1702  major facilitator transporter  99.77 
 
 		 434 aa  855    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0134647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2388  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2475  major facilitator family protein  54.85 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2518  transporter major facilitator family  54.85 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2426  transporter, major facilitator family  54.85 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1403  major facilitator transporter  54.61 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.197119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02172  predicted transporter  54.37 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1412  major facilitator superfamily MFS_1  54.37 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.787988  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2530  major facilitator family transporter  54.61 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2634  major facilitator family transporter  54.61 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02131  hypothetical protein  54.37 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 436 aa  362  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  48.64 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.9 
 
 		 442 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  44.95 
 
 		 434 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  44.28 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  42.49 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  43.56 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09210  MFS transporter  45.37 
 
 		 467 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0534  tartrate transporter, putative  39.63 
 
 		 428 aa  306  7e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1456  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 437 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 437 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 442 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  37 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  36.49 
 
 		 441 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  36.68 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  36.88 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  39.73 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.42 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  37.68 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  36.02 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  36.02 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  36.02 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  36.02 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  36.02 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  36.02 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 448 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 440 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 441 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 441 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 437 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 441 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  37.41 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3384  major facilitator superfamily MFS_1  52.8 
 
 		 252 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  40.31 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  36.84 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  35.73 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  37.28 
 
 		 444 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4248  MFS permease  38.92 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  36.6 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>