176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0120 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  100 
 
 		 162 aa  330  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  54.37 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  51.09 
 
 		 177 aa  147  9e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  46.05 
 
 		 758 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  38.46 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  40.62 
 
 		 193 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  42.04 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  39.72 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  39.72 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40 
 
 		 252 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  39.57 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.85 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  39.86 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  38.85 
 
 		 242 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  39.57 
 
 		 207 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  38.85 
 
 		 213 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  38.85 
 
 		 213 aa  104  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  39.57 
 
 		 245 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.85 
 
 		 242 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.85 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  36.59 
 
 		 186 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  36.13 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  36.13 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  36.13 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  36.13 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  36.13 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  36.13 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  36.13 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  36.36 
 
 		 223 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  34.33 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  40.44 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  38.26 
 
 		 205 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  36.88 
 
 		 176 aa  94.4  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  45.69 
 
 		 208 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  36.88 
 
 		 176 aa  94.4  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  37.41 
 
 		 219 aa  94  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  34.46 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.09 
 
 		 229 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  34.78 
 
 		 197 aa  91.3  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  33.82 
 
 		 230 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  32.35 
 
 		 230 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  38.58 
 
 		 196 aa  87.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  33.91 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.72 
 
 		 196 aa  85.1  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  36.29 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  37.78 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  34.27 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  31.62 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  32.65 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  32.65 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  33.57 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  34.75 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  35.33 
 
 		 393 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.63 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.16 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.86 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  28.68 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.24 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  30.77 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  27.5 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  28.67 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  28.97 
 
 		 481 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  25.68 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.32 
 
 		 484 aa  53.9  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  28.32 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  28.15 
 
 		 300 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.8 
 
 		 366 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0252  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 		 356 aa  50.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0354  phospholipase D/transphosphatidylase  27.01 
 
 		 191 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00184279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  23.18 
 
 		 260 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.9 
 
 		 219 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  27.13 
 
 		 311 aa  50.4  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  26.92 
 
 		 477 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2796  hypothetical protein  33.68 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0482  phospholipase D/transphosphatidylase  27.59 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.858411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  28.57 
 
 		 480 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  28.95 
 
 		 479 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3962  cardiolipin synthetase 2  27.83 
 
 		 470 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1565  phospholipase D/transphosphatidylase  27.01 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  26.06 
 
 		 448 aa  48.9  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3563  cardiolipin synthetase 2  24.35 
 
 		 467 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.483916 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  31.78 
 
 		 486 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.09 
 
 		 474 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  31.78 
 
 		 486 aa  48.5  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  29.27 
 
 		 484 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  28.95 
 
 		 477 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1459  hypothetical protein  30.85 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1592  hypothetical protein  30.53 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  23.4 
 
 		 543 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1489  hypothetical protein  30.53 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  25.36 
 
 		 286 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  30.84 
 
 		 487 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  25.36 
 
 		 286 aa  47.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  25.81 
 
 		 472 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  25.86 
 
 		 558 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>