163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0569 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  100 
 
 
1273 aa  2551    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  63.8 
 
 
1285 aa  1605    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  99.21 
 
 
1273 aa  2534    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  57.26 
 
 
1285 aa  1424    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.66 
 
 
1262 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  29.48 
 
 
1352 aa  288  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  26.87 
 
 
1382 aa  251  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.4 
 
 
1224 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  26.61 
 
 
1221 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.53 
 
 
1206 aa  236  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  28.47 
 
 
1283 aa  231  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.52 
 
 
1224 aa  230  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  28.14 
 
 
1224 aa  229  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.16 
 
 
1255 aa  229  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  29.11 
 
 
1223 aa  227  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.79 
 
 
1221 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  26.28 
 
 
1256 aa  214  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.31 
 
 
1226 aa  212  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  28.97 
 
 
1232 aa  211  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.41 
 
 
1229 aa  205  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.93 
 
 
1226 aa  201  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  22.48 
 
 
1328 aa  200  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  25.61 
 
 
1259 aa  200  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  25.61 
 
 
1259 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  23.54 
 
 
1265 aa  199  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  25.37 
 
 
1259 aa  199  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  25.29 
 
 
1258 aa  198  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  25.11 
 
 
1259 aa  198  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  25.21 
 
 
1259 aa  198  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  25.11 
 
 
1259 aa  198  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  25.11 
 
 
1259 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  25.26 
 
 
1259 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  25.23 
 
 
1259 aa  196  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  25.4 
 
 
1259 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  24.59 
 
 
1254 aa  196  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  25.11 
 
 
1259 aa  196  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  25.11 
 
 
1259 aa  196  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  25 
 
 
1259 aa  195  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  25.12 
 
 
857 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.21 
 
 
1025 aa  191  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  24.4 
 
 
1291 aa  189  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  26.38 
 
 
1246 aa  188  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  24.4 
 
 
1312 aa  188  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  25.44 
 
 
1249 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  24.4 
 
 
1305 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  27.63 
 
 
1174 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.18 
 
 
1259 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.21 
 
 
1340 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  24.8 
 
 
1342 aa  179  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  25.59 
 
 
1773 aa  167  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  32.92 
 
 
1308 aa  164  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  27.63 
 
 
1056 aa  162  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  22.72 
 
 
1290 aa  162  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  26.88 
 
 
846 aa  162  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  24.84 
 
 
1664 aa  160  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  22.88 
 
 
1254 aa  158  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  26.43 
 
 
846 aa  158  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.12 
 
 
1664 aa  157  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.33 
 
 
1319 aa  155  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.74 
 
 
1353 aa  151  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  28.06 
 
 
1325 aa  147  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  23.44 
 
 
929 aa  145  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.04 
 
 
1290 aa  145  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.44 
 
 
1299 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.36 
 
 
1305 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  23.21 
 
 
929 aa  143  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.67 
 
 
1297 aa  141  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.65 
 
 
1377 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.57 
 
 
1319 aa  140  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  24.32 
 
 
1401 aa  136  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  26.28 
 
 
1485 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  28.14 
 
 
1184 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  28.14 
 
 
1184 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  22.41 
 
 
1304 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  23.14 
 
 
1344 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.76 
 
 
1485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  23.49 
 
 
1174 aa  129  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  23.04 
 
 
1344 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  23.04 
 
 
1344 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  23.23 
 
 
1341 aa  128  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  21.96 
 
 
1302 aa  127  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  23.97 
 
 
1299 aa  126  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.62 
 
 
1304 aa  126  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  30.18 
 
 
1453 aa  125  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.45 
 
 
1304 aa  125  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  27.68 
 
 
1434 aa  123  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  24.32 
 
 
982 aa  115  7.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  23.3 
 
 
1392 aa  113  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.31 
 
 
1310 aa  112  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  24.84 
 
 
1385 aa  110  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  22.03 
 
 
1402 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  21.99 
 
 
1398 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  24.18 
 
 
1449 aa  108  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.29 
 
 
1292 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  27.12 
 
 
1355 aa  105  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.61 
 
 
1361 aa  104  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.11 
 
 
1243 aa  103  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  23.83 
 
 
1359 aa  103  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  26.14 
 
 
1218 aa  102  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.19 
 
 
1375 aa  101  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>