92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0767 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  100 
 
 
303 aa  594  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  57.25 
 
 
301 aa  297  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  37.16 
 
 
309 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  34.38 
 
 
309 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  31.47 
 
 
308 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  28.43 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  34.55 
 
 
308 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  30.07 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  27.8 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  26.33 
 
 
304 aa  108  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.85 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  22.61 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  22.97 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  22.78 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  22.78 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  26.37 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  22.65 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  22.3 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  24.48 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  22.3 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  22.3 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  21.25 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.73 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.82 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.5 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.75 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  21.5 
 
 
311 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  23.15 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.57 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.32 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  21.17 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  23.64 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.5 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  22.42 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  22.22 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  25.85 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  24.82 
 
 
300 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.66 
 
 
315 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  21.14 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  26.4 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.13 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  23.59 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.44 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  25.85 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
330 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  25.54 
 
 
318 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  23.83 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  23.92 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  22.95 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  22.49 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  23.55 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.88 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  21.37 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  24.89 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  23.83 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  25.5 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  23.22 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.78 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.54 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  21.99 
 
 
310 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  22.07 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  23.6 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.74 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  24.39 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  22.46 
 
 
322 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  22.02 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4929  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
319 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  23.86 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.47 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  22.97 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.43 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  22.9 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  22.6 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  22.37 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  22.6 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.47 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  21.5 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  25 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25.9 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  23.17 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  20.85 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  25.52 
 
 
367 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.21 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>