198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3179 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 279 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  50.71 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  51.61 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 286 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  55.36 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  53.71 
 
 		 286 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  52.3 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  47.12 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  50.18 
 
 		 286 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  51.79 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  50.54 
 
 		 311 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  47.86 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3888  UspA domain protein  51.35 
 
 		 264 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0925098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  36.07 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  36.82 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.63 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  41.71 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  30.71 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  38.92 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  40.11 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  37.2 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  33.2 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  33.21 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  37.97 
 
 		 265 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  44.52 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  30.37 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  35.45 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  42.95 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  28.73 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  42.57 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  41.61 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  36.16 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  39.89 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  45.33 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  32.81 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  38.71 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  39.2 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.88 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  36.9 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.21 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  36.59 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  40.54 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  44.16 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  37.36 
 
 		 242 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  43.06 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  39.07 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  36.78 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  40.67 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  38.19 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  36.02 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  34.76 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.37 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  34.76 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  29.55 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  29.55 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  29.55 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  29.55 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  29.55 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  29.55 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  39.35 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  41.21 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  36.43 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  35.76 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  33.87 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  39.22 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  39.22 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  41.89 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  38.59 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  40.27 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  34.83 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.37 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  34.36 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  28.52 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  36.17 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  35.18 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  35.18 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  37.18 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.24 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>