65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1124 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  32.56 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  36.7 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  33.04 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  34.11 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  34.53 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.89 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  32.33 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  34.23 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  35.83 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  34.59 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  37.76 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  33.05 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  29.46 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  33.05 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  27.82 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  35.59 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  32.08 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  30.47 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  31.53 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  30.25 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  34 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  32.23 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  28.37 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.41 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  25.23 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  34.44 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  31.71 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  30.19 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  34.58 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  27.21 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  32.38 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  48.89 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  28.04 
 
 		 280 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  30.1 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  22.9 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  29.1 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  29.58 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  32 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  27.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  26.77 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  32 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  28.32 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  29.23 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  22.64 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  25.87 
 
 		 202 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  29.63 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  25.98 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  26.89 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.03 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  34.31 
 
 		 148 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  32.5 
 
 		 157 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2654  hypothetical protein  32.65 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3486  hypothetical protein  28.16 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  32.53 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0627  hypothetical protein  30.61 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  33.03 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>