193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0308 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  100 
 
 
300 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  58.55 
 
 
301 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  58.09 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  57.84 
 
 
302 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  56.99 
 
 
297 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  55.1 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  55.63 
 
 
288 aa  299  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  56.25 
 
 
297 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  54.41 
 
 
297 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  54.86 
 
 
297 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  53.33 
 
 
293 aa  272  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  50.93 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  50.92 
 
 
283 aa  268  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  51.11 
 
 
288 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  51.48 
 
 
286 aa  258  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  51.48 
 
 
286 aa  258  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  54.12 
 
 
295 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  52.04 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  50.36 
 
 
315 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  50.36 
 
 
315 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  47.42 
 
 
290 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  47.23 
 
 
298 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  47.79 
 
 
307 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  48.34 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  42.86 
 
 
285 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  37.68 
 
 
288 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.97 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  27.54 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.56 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  27.7 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.47 
 
 
288 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.47 
 
 
288 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.69 
 
 
286 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.16 
 
 
289 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.16 
 
 
289 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.16 
 
 
289 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.16 
 
 
289 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.16 
 
 
289 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.16 
 
 
289 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  30.96 
 
 
299 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.39 
 
 
392 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.5 
 
 
316 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  27.37 
 
 
276 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  31.39 
 
 
299 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  28.29 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  25.35 
 
 
274 aa  96.7  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  28.67 
 
 
316 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.46 
 
 
328 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.49 
 
 
321 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  26.24 
 
 
279 aa  89  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  28.24 
 
 
271 aa  88.2  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.72 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.73 
 
 
363 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  26.86 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.91 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.32 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  23.51 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.37 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.21 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.91 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.91 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  30.59 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.91 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  26.24 
 
 
277 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.91 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  29.39 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.86 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  25 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  24.67 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.03 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.15 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  29.15 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  25.4 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.27 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  31.41 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  29.31 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  23.64 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  27.78 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  26.1 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.57 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.18 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  24.24 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  24.91 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24.81 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28.77 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.17 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  32.14 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  23.32 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0036  putative ribonuclease BN  29.18 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  30.96 
 
 
360 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  21.35 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.73 
 
 
377 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  26.55 
 
 
350 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  23.53 
 
 
371 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  26.55 
 
 
350 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  25 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  26.55 
 
 
350 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  22.83 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  23.29 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  21.96 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>