More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4676 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4676  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  59.51 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  46.8 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  47.83 
 
 		 326 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.75 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  41.78 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.94 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.91 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.75 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.79 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.73 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.93 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.05 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.82 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.27 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.67 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.31 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.67 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.31 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  35.94 
 
 		 329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  37.5 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.32 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.81 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  39.8 
 
 		 338 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.49 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.92 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.17 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.51 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.51 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.04 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  38.56 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.35 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.35 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  37.92 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.43 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.31 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.25 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.21 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.83 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.68 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.2 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.26 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.33 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.6 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.04 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.25 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.85 
 
 		 327 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.85 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  37.35 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  38.21 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.53 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.96 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.19 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.05 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  36.36 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.42 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.81 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.02 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.81 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.58 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.33 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  41.12 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  37.11 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  35.69 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.1 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.05 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.74 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  40.21 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  36.65 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.22 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  39.39 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.49 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.77 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.32 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.8 
 
 		 321 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  41.3 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  35.58 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  37.07 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  42.09 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.34 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  39.6 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  34.87 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  38.28 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  40.4 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.57 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  37.93 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  36.28 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  39.12 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  37.67 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.99 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  37.37 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.7 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  37.01 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>