More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2519 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  88.2 
 
 
330 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  49.83 
 
 
379 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  50.5 
 
 
360 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  47.84 
 
 
356 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  41.93 
 
 
327 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.61 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  43.26 
 
 
335 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  43.77 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  42.45 
 
 
341 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.91 
 
 
341 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  44.34 
 
 
331 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.91 
 
 
336 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.3 
 
 
332 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.62 
 
 
330 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  40.36 
 
 
332 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.83 
 
 
327 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  39.76 
 
 
332 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.81 
 
 
331 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.61 
 
 
337 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  36.48 
 
 
324 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.34 
 
 
344 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.11 
 
 
331 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  39.37 
 
 
315 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  38.63 
 
 
327 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0546  hypothetical protein  40.07 
 
 
332 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.371672  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.59 
 
 
345 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.59 
 
 
345 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  38.49 
 
 
336 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.94 
 
 
325 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.61 
 
 
356 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.21 
 
 
338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.56 
 
 
327 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.06 
 
 
321 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.32 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.33 
 
 
349 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37.35 
 
 
330 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.75 
 
 
328 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.42 
 
 
328 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  41.31 
 
 
345 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.02 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  41.18 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.53 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  38.85 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  40.34 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  38.38 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  41.9 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  38.79 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  39.13 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  39.81 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.06 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  38.49 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.91 
 
 
698 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.04 
 
 
346 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  37.67 
 
 
339 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  38.56 
 
 
325 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.72 
 
 
331 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  38.81 
 
 
328 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.7 
 
 
322 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.54 
 
 
339 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.66 
 
 
360 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.45 
 
 
332 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  41.42 
 
 
343 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  36.65 
 
 
327 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  41.61 
 
 
333 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.62 
 
 
339 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.53 
 
 
324 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  38.99 
 
 
386 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.74 
 
 
339 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.17 
 
 
318 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4556  hypothetical protein  42.31 
 
 
337 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.912833  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  37.83 
 
 
318 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  38.56 
 
 
363 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 
330 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 
322 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.02 
 
 
330 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.79 
 
 
328 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.79 
 
 
328 aa  208  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 
326 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.95 
 
 
325 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  35.64 
 
 
341 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.31 
 
 
322 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.99 
 
 
325 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  36.13 
 
 
335 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.94 
 
 
325 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  37.77 
 
 
327 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.51 
 
 
333 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.27 
 
 
328 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.87 
 
 
324 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  39.39 
 
 
330 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  39.39 
 
 
334 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  40 
 
 
334 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  35.42 
 
 
323 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  36.86 
 
 
324 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  37.83 
 
 
332 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  39.14 
 
 
337 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.54 
 
 
318 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  39.24 
 
 
342 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  40.2 
 
 
339 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>