More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1959 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 418 aa  845    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  36.45 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  38.78 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  33.08 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  32.35 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 440 aa  153  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  30.12 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.73 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 424 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 405 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  29.98 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.55 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  33.19 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  33.19 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  33.19 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  33.77 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 376 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  28.25 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  30.86 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1774  extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110922  normal  0.433234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  30.3 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  28.37 
 
 		 415 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  28.54 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 371 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.19 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.91 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.97 
 
 		 515 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  29.96 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.75 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.19 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  30.8 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.75 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  31.09 
 
 		 374 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  30.71 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.76 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  31.47 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>