More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1862 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  76.51 
 
 
494 aa  772    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  81.21 
 
 
486 aa  808    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  100 
 
 
493 aa  1007    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  65.21 
 
 
490 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  64.58 
 
 
486 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  57.76 
 
 
488 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  56.39 
 
 
484 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  56.54 
 
 
491 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  56.12 
 
 
478 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  56.12 
 
 
478 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.91 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.7 
 
 
478 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.49 
 
 
478 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.07 
 
 
477 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  51.66 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  51.66 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  51.06 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  51.66 
 
 
493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.96 
 
 
493 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  51.59 
 
 
493 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.21 
 
 
491 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.21 
 
 
493 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50 
 
 
493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50 
 
 
493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.79 
 
 
493 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.57 
 
 
493 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.74 
 
 
493 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50 
 
 
493 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.79 
 
 
493 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  50 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.79 
 
 
475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.79 
 
 
475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.79 
 
 
475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.88 
 
 
479 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.47 
 
 
495 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.79 
 
 
475 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.88 
 
 
480 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  48.76 
 
 
487 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.84 
 
 
487 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  47.36 
 
 
493 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  47.02 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.07 
 
 
494 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.07 
 
 
494 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  44.56 
 
 
481 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.72 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.88 
 
 
499 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.73 
 
 
490 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.55 
 
 
493 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  36.24 
 
 
530 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.79 
 
 
532 aa  306  6e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  36.31 
 
 
530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  36.69 
 
 
533 aa  289  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.47 
 
 
534 aa  273  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.81 
 
 
522 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.71 
 
 
516 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.25 
 
 
534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  35.74 
 
 
558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.81 
 
 
534 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  33.58 
 
 
1076 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.27 
 
 
547 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.62 
 
 
528 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  34.85 
 
 
533 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.59 
 
 
499 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.96 
 
 
533 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35 
 
 
529 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.82 
 
 
546 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  31.24 
 
 
557 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.3 
 
 
525 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.58 
 
 
565 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.77 
 
 
507 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.5 
 
 
529 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.27 
 
 
848 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.49 
 
 
487 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  33.46 
 
 
539 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.52 
 
 
651 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.53 
 
 
511 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.77 
 
 
531 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  28.03 
 
 
534 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  30.12 
 
 
456 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  28.73 
 
 
523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  34.39 
 
 
620 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.09 
 
 
532 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.57 
 
 
527 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.17 
 
 
545 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  30.1 
 
 
528 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.15 
 
 
548 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  29.19 
 
 
560 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  30.27 
 
 
481 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  38.21 
 
 
582 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.5 
 
 
558 aa  146  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  36.56 
 
 
590 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  35.24 
 
 
581 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  31.35 
 
 
589 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  42.27 
 
 
560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  40.59 
 
 
587 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  42.93 
 
 
588 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  39.11 
 
 
577 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  38.19 
 
 
578 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  43.65 
 
 
579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  27.12 
 
 
493 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>