More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1301 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  82.71 
 
 		 408 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  77.92 
 
 		 408 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  82.91 
 
 		 408 aa  693    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  81.45 
 
 		 415 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  100 
 
 		 404 aa  824    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  75.38 
 
 		 424 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  70.33 
 
 		 447 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  69.86 
 
 		 427 aa  584  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  51.52 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  53.51 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.87 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  51.4 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  52.99 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  53.77 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  51.7 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  54.09 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.55 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  51.3 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  50.13 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  49.74 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  52.21 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.35 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  50 
 
 		 388 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.6 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  48.58 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.6 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.72 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.33 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  50 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  54.03 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  51.31 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.49 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  50.13 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.67 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.06 
 
 		 404 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  48.21 
 
 		 388 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47.7 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  46.39 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.52 
 
 		 397 aa  362  9e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.45 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.93 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.22 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  51.31 
 
 		 385 aa  359  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.31 
 
 		 385 aa  359  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.81 
 
 		 387 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.81 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  46.13 
 
 		 387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  47.01 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.94 
 
 		 401 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  49.48 
 
 		 390 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  50 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.68 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  49.1 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.41 
 
 		 397 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.56 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  48.05 
 
 		 386 aa  352  7e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  51.17 
 
 		 405 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  49.61 
 
 		 392 aa  349  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  50.52 
 
 		 406 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.75 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.53 
 
 		 387 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  46.56 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  45.81 
 
 		 387 aa  346  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.7 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.7 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  47.41 
 
 		 386 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.7 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.27 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  47.63 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 		 391 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.23 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.7 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  45.55 
 
 		 387 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  46.56 
 
 		 387 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.7 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  47.29 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.07 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.07 
 
 		 415 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.07 
 
 		 415 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  50.51 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.44 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  45.62 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.66 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.92 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  47.75 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  48.06 
 
 		 390 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.19 
 
 		 379 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.66 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  47.48 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  48.32 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.7 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  45.1 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  47.72 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.31 
 
 		 399 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>