More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0898 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  67.76 
 
 		 245 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  66.25 
 
 		 245 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  49.38 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  48.35 
 
 		 244 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  48.96 
 
 		 244 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  48.52 
 
 		 243 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  50.21 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  47.72 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  51.05 
 
 		 244 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  45.06 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  47.01 
 
 		 242 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.23 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  43.15 
 
 		 241 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  47.9 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  48.32 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  41.73 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  44.4 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  43.85 
 
 		 603 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  43.57 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  41.95 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  45.23 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  44.4 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  45.99 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.25 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.26 
 
 		 609 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.18 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  43.62 
 
 		 616 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.77 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  46.41 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  43.08 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  42.17 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  42.17 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  42.17 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  43.28 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 294 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 293 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  47.23 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 589 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  41.34 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  42.17 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  44.07 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  42.92 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.22 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.77 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.77 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.77 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  40.78 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  41.25 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  41.18 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.96 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  42.63 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  43.4 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  39.92 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  41.04 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  40.96 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  42.35 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  40.25 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  39.53 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.17 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  39.36 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  39.51 
 
 		 302 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  39.41 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  41.27 
 
 		 334 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  41.03 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  40.64 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  40.64 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.85 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  43.82 
 
 		 261 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  42.23 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.53 
 
 		 333 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.4 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  40.87 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  40.33 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  38.55 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 		 590 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  41.43 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  41.43 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4649  ABC transporter related  39.69 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  39.36 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>