More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0184 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  78.14 
 
 		 431 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  78.14 
 
 		 431 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 434 aa  873    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  66.59 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  66.36 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  68.93 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  52.22 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  55.61 
 
 		 436 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  55.71 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  55.61 
 
 		 436 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  51.97 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  51.96 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  52.13 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  51.66 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  45.93 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  46.39 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  46.39 
 
 		 430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 435 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  38.65 
 
 		 427 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  38.65 
 
 		 427 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 433 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 434 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  43.32 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 423 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  39.14 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  36.23 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  36.23 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  35.73 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 478 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 429 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  37.67 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.95 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.95 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.21 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  34.78 
 
 		 427 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.98 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.74 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.66 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 434 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.32 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.71 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.9 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 428 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.18 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 427 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.84 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.86 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 436 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>