More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4405 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  71.12 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  67.88 
 
 		 330 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  66.97 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  61.03 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  62.73 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  51.96 
 
 		 328 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  48.93 
 
 		 355 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  46.48 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  47.58 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  48.62 
 
 		 328 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  44.74 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  45.6 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  40.13 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  39.94 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  37.8 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.21 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  37.8 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  37.39 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.52 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.24 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  39.38 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.17 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.84 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38.44 
 
 		 339 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.6 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0792  hypothetical protein  40.36 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.01 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.05 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.05 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.49 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  35.47 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.69 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  37 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.74 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.15 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.15 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  34.46 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  38.06 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.1 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  41.78 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.26 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.52 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4073  hypothetical protein  37.59 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.72 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.81 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3417  hypothetical protein  37.59 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.63 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.72 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.2 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  38.1 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  36.25 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  36.81 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  35.14 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.38 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  39.04 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.29 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  34.46 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.15 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.47 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.18 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.35 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.15 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.85 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.51 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  34.64 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2546  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.15 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  33.45 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  33.94 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  35.67 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  35.76 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  35.67 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  36.96 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  38.06 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.58 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  36.73 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  36.36 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  36.99 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.27 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.81 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.56 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.08 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  32.31 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.31 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  35.49 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  35.18 
 
 		 319 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  35.81 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.11 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  34.25 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>