More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2598 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2598  amidase  100 
 
 		 441 aa  882    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  64.17 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  63.98 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2586  amidase  64.89 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.182756  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1222  amidase  65.11 
 
 		 448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.819816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  63.64 
 
 		 450 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1437  amidase  62.58 
 
 		 457 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  56.74 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1980  amidase  56.25 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.078778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  52.35 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1873  amidase  53.59 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.028734  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  51.79 
 
 		 449 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  51.26 
 
 		 463 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  51.3 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  46.57 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  49.23 
 
 		 447 aa  346  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  46.31 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  49.49 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  51.28 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  50.82 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  50.13 
 
 		 453 aa  329  6e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  48.21 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  49.74 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  49.35 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  50.39 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0511  amidase  50.77 
 
 		 452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.227764  normal  0.354822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0498  amidase  51.4 
 
 		 453 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  46.15 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0849  amidase  51.37 
 
 		 457 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0543  amidase  50.26 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1022  amidase  50.26 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0886  amidase  50.39 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0457  amidase  50.52 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0172  amidase  50.52 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2972  amidase  50.52 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2603  amidase  50.52 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0975  amidase  50.52 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2912  amidase  50.52 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3019  amidase  50.52 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1615  amidase  50.26 
 
 		 476 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3039  amidase  52.7 
 
 		 459 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0144901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0375  amidase  50 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2373  amidase  50.63 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.172114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0898  amidase  50.39 
 
 		 458 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0952  amidase  51.8 
 
 		 481 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4134  amidase  49.75 
 
 		 458 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0981  amidase  49.74 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0651175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0715  amidase  46.05 
 
 		 462 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  41.22 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  39.22 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  42.38 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  42.49 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  42.45 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  42.99 
 
 		 427 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5041  amidase  43.85 
 
 		 435 aa  233  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0912342  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3413  hypothetical protein  37.76 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2984  amidase  42.42 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  37.1 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1307  amidase  41.28 
 
 		 451 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256465  normal  0.0218036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  39.9 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  40.4 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3988  amidase  39.49 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43113 
 
 
-
 
NC_004310  BR0573  amidase  37.37 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4452  amidase  39.43 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4084  amidase  39.2 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2797  amidase  36.1 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  35.39 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1721  amidase  43.23 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0870166  normal  0.409578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2898  amidase  36.1 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0193721  normal  0.48619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.03 
 
 		 467 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  36.32 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  38.32 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  34.3 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  35.99 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  34.09 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1493  amidase  34.91 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0061  amidase  36.25 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.222867  hitchhiker  0.0000105372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.98 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  33.89 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0143  amidase  34.82 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0981668  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.5 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  38.44 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4618  amidase  34.76 
 
 		 473 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  36.36 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  31.04 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0901  amidase  35.29 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.0184899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.7 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  32.73 
 
 		 601 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  32.04 
 
 		 462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2093  hypothetical protein  33.56 
 
 		 477 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  33.41 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  33 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  31.57 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.64 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0220  amidase  33.6 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.855119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4057  allophanate hydrolase  32.27 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  33.42 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.62 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  32.36 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0333525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>