More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1029 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1029  binding-protein-dependent transport system,inner membrane component  100 
 
 
295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000663  ABC transporter permease protein  82.25 
 
 
296 aa  461  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.27 
 
 
280 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0147671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1684  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.26 
 
 
278 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.43 
 
 
279 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.975763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.8 
 
 
275 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301852  normal  0.487139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.43 
 
 
279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.22443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.05 
 
 
279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0106315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21930  putative permease of ABC transporter  60.31 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498277  hitchhiker  0.000000164352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3880  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  56.39 
 
 
280 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1604  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.39 
 
 
280 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.082951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1873  ABC transporter permease  60.31 
 
 
279 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.72 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.448719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.09 
 
 
280 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.6 
 
 
280 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1103  ABC transporter, permease protein  45.65 
 
 
280 aa  240  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 
574 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0830  ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0374043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0753  ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.644714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55789  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2949  ABC transporter membrane spanning protein  36.13 
 
 
330 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0104  acriflavin resistance protein  35.29 
 
 
302 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
296 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.596168  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0114  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 
294 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
297 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
298 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
298 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.326549  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
297 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331277  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
314 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0499  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.32 
 
 
290 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4200  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  33.45 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300968  normal  0.737263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
312 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387102  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0347  ABC transporter, inner membrane subunit  34.55 
 
 
293 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138515  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
293 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.235155  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
293 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3327  hypothetical protein  32.7 
 
 
280 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0941413  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
284 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
288 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
284 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
284 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7382  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1110  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  30.37 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0532784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
283 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.691265  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.77 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 
276 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1787  putative ABC transport system, membrane protein  25.67 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0355  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359414  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0449  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2081  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1819  putative ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1108  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.959603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0817  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.93 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.875923  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.68 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.93 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
569 aa  66.2  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0487  ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.63 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.45 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298805  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.43 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.43 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  23.18 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.32 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4841  putative ABC transporter membrane protein  25.64 
 
 
272 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.43 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.91 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4342  ABC transporter, inner membrane subunit  26.19 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.71 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1109  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2830  ABC transporter, permease protein  25.79 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.14 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  24.27 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.12 
 
 
271 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  26.84 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.74 
 
 
588 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1494  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  24.23 
 
 
259 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.968283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.68 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.91 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
572 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
262 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4694  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.33 
 
 
289 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317498  normal  0.323079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130981  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1683  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  26.56 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  26.98 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>