More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0408 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  64.39 
 
 		 297 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  62.5 
 
 		 284 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  42.31 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  41.48 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  40.36 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  34.27 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  35.47 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  35.07 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  33.09 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  33.81 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  45.77 
 
 		 215 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  32.52 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  31.77 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  32.13 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  31.56 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  32.01 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  32.03 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  34.89 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  32.01 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  32.69 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  28.04 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  29.04 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  29.74 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  28.68 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  29.37 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  29.37 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.7 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.83 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.23 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  29.03 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  33.67 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.78 
 
 		 310 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  27.96 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  28.62 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.36 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.94 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  25.96 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.59 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  27.5 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  27.88 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.78 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  26.62 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.17 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  28.74 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  30.31 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  27.92 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  33.66 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.96 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  30.48 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.11 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  26.49 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  26.77 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  32.18 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  25.68 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  28.64 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  25.34 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  23.94 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  31.54 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  27.24 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  25.54 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  27.57 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  26.03 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.74 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  30.09 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.85 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  27.75 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  25.96 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  25.68 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  29.5 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  25.66 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  26.05 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  26.64 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  26.03 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  26.47 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  26.47 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  26.91 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  27.64 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  27.94 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>