More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04772 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  95.02 
 
 		 221 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  64.41 
 
 		 222 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  59.46 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  61.86 
 
 		 236 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  61.86 
 
 		 236 aa  271  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  61.86 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  61.86 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  62.32 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  61.57 
 
 		 223 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  60.91 
 
 		 221 aa  269  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  57.38 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  61.35 
 
 		 223 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  60.87 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  60.87 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  59.91 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.44 
 
 		 218 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  43.58 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  42.4 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 345 aa  179  4e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.55 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.1 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  43.2 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  39.07 
 
 		 604 aa  178  7e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  41.1 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  43.98 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  39.01 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  39.3 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  40.27 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  42.4 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  44.91 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  40.36 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  44.39 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  43.93 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  45 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  40.83 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  39.82 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  40.55 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  44.44 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  40.55 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  39.29 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  38.79 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  40.27 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.17 
 
 		 642 aa  170  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  37.17 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  40.53 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  44.44 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  39.29 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  41.94 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  39.19 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  40.55 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  37.3 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  41.63 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  41.18 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  39.53 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  44.04 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  40.57 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  41.18 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  38.39 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  41.18 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  42.58 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  41.18 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  42.15 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>