More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0181 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  47.49 
 
 
800 aa  730    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  46.15 
 
 
740 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  50.92 
 
 
777 aa  702    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.33 
 
 
758 aa  1019    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
755 aa  1564    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.97 
 
 
757 aa  894    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.81 
 
 
751 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.52 
 
 
742 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.01 
 
 
749 aa  1052    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  64.03 
 
 
762 aa  1063    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  45.62 
 
 
737 aa  674    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  47.76 
 
 
749 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  44.58 
 
 
741 aa  644    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  46.17 
 
 
750 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  51.46 
 
 
747 aa  782    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.66 
 
 
750 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  66.49 
 
 
755 aa  1070    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.29 
 
 
758 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.08 
 
 
790 aa  724    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  44.52 
 
 
757 aa  630  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  46.38 
 
 
760 aa  625  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.25 
 
 
748 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  41.21 
 
 
874 aa  609  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  46.83 
 
 
809 aa  594  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.18 
 
 
737 aa  582  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.94 
 
 
780 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.32 
 
 
813 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.69 
 
 
734 aa  524  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  42.53 
 
 
793 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  42.38 
 
 
793 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  39.97 
 
 
745 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  41.04 
 
 
738 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  40.52 
 
 
722 aa  489  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  41.18 
 
 
721 aa  489  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  38.55 
 
 
721 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.12 
 
 
711 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  40.03 
 
 
708 aa  464  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.02 
 
 
757 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  39.7 
 
 
717 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  40.22 
 
 
714 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  40.34 
 
 
701 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.1 
 
 
497 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  37.91 
 
 
814 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  37.78 
 
 
716 aa  451  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.42 
 
 
933 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  39.07 
 
 
987 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 
1072 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  36.31 
 
 
685 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  36.26 
 
 
731 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.78 
 
 
756 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  37.44 
 
 
693 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  35.67 
 
 
733 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  35.67 
 
 
733 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  35.67 
 
 
733 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.61 
 
 
1158 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.6 
 
 
922 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.41 
 
 
731 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  36.29 
 
 
733 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  35.67 
 
 
733 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.27 
 
 
731 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  35.7 
 
 
730 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 
746 aa  372  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  34.91 
 
 
733 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  35.05 
 
 
733 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  36.23 
 
 
748 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.02 
 
 
1321 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.45 
 
 
762 aa  361  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  34.3 
 
 
748 aa  356  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  34.92 
 
 
737 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  35.53 
 
 
691 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.71 
 
 
1338 aa  347  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  35.24 
 
 
751 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  35.1 
 
 
751 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  35.24 
 
 
751 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  34.96 
 
 
748 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  35.39 
 
 
779 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  34.58 
 
 
790 aa  343  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  33.66 
 
 
735 aa  335  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.42 
 
 
772 aa  334  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.06 
 
 
771 aa  333  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  31.53 
 
 
777 aa  333  6e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  33.47 
 
 
737 aa  332  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 
805 aa  330  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  32.34 
 
 
727 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  32.55 
 
 
753 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 
743 aa  327  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.22 
 
 
829 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 
754 aa  324  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.4 
 
 
765 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  32.53 
 
 
731 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.06 
 
 
724 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  45.81 
 
 
914 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.65 
 
 
778 aa  320  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.62 
 
 
782 aa  320  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.5 
 
 
751 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  30.83 
 
 
822 aa  319  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 
772 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.89 
 
 
766 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.51 
 
 
778 aa  318  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.96 
 
 
760 aa  317  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>