More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0526 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
245 aa  488  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  58.54 
 
 
246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  56.2 
 
 
245 aa  279  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  57.38 
 
 
242 aa  275  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  55.51 
 
 
249 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  55.1 
 
 
245 aa  265  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  57.96 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  53.69 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  55.92 
 
 
252 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  53.69 
 
 
248 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.44 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  51.02 
 
 
247 aa  252  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  48.59 
 
 
256 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  48.59 
 
 
263 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.31 
 
 
256 aa  250  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  52.89 
 
 
256 aa  249  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  52.89 
 
 
256 aa  248  9e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  47.79 
 
 
256 aa  248  9e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  47.79 
 
 
256 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  54.55 
 
 
240 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  48.36 
 
 
245 aa  245  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  50.62 
 
 
251 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  48.41 
 
 
261 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  48.77 
 
 
247 aa  236  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  48.24 
 
 
281 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  46.72 
 
 
246 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  45.82 
 
 
264 aa  226  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  45.97 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  36.07 
 
 
670 aa  169  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.52 
 
 
659 aa  151  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  40.39 
 
 
646 aa  139  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.33 
 
 
572 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  36.12 
 
 
568 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  37 
 
 
568 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  32.66 
 
 
553 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.89 
 
 
776 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.3 
 
 
793 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.87 
 
 
777 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2600  glutamate synthase, alpha subunit-like  32.18 
 
 
771 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1370  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.61 
 
 
794 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.35 
 
 
777 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.79 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0102  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.46 
 
 
777 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.47 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  29.77 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2159  glutamate synthase alpha subunit  31.18 
 
 
771 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681462  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.37 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  26.14 
 
 
1465 aa  67  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  29.57 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  38.06 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  31.21 
 
 
1536 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  26.49 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  30.16 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 
1533 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.16 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.57 
 
 
1530 aa  62  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  28.62 
 
 
1461 aa  62  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.46 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  37.89 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.76 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  32.47 
 
 
1487 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.41 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.42 
 
 
1527 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.95 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  27.27 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.7 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  25 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.34 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  29.71 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.06 
 
 
1524 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  33.12 
 
 
1487 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.67 
 
 
1474 aa  58.9  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.3 
 
 
1521 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  31.54 
 
 
1535 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.29 
 
 
1512 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.61 
 
 
1554 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  29.65 
 
 
1487 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.41 
 
 
1527 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.94 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.97 
 
 
1554 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  31.34 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.34 
 
 
1527 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.12 
 
 
1551 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  34.13 
 
 
425 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  24.06 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.69 
 
 
1531 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  29.57 
 
 
1482 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  26.96 
 
 
1510 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  30.35 
 
 
1528 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  27.85 
 
 
1533 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  25.24 
 
 
2126 aa  55.8  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.45 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  29.17 
 
 
1460 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  32.45 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  30.43 
 
 
229 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  27.19 
 
 
1510 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  34.51 
 
 
254 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  25.87 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  32.47 
 
 
1483 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>