More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0600 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0600  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  577  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1504  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1582  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0317  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1804  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.68636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0591  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000340346 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0826  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0445  inner-membrane translocator  34 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1979  putative branched-chain amino acid transport system / permease component  31.76 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3203  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 422 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  31.6 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  30.56 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.52 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2158  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2888  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1231  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 431 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  30.77 
 
 		 481 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 289 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1577  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0108  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 493 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1148  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1275  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.732042 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.33 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  30.03 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3086  inner-membrane translocator  28.22 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1518  hypothetical protein  32.09 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.442526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.96 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1571  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.350199  normal  0.598455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  28.28 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.48 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2926  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.82 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  29.04 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3840  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.927724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  28.62 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.37 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  28.15 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  28 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  26.25 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  27.99 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1158  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 446 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  26.79 
 
 		 373 aa  95.9  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  25.74 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3963  inner-membrane translocator  30 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1740  inner-membrane translocator  28.04 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  27.24 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  26.96 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>