166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0392 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  52.69 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  53.76 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  50.78 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  52.15 
 
 		 203 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  49.49 
 
 		 200 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  49.48 
 
 		 196 aa  197  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  43.81 
 
 		 196 aa  174  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  45.6 
 
 		 198 aa  172  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  45.45 
 
 		 211 aa  164  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  44.75 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  41.44 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  42.44 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  42.79 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  40.61 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  40.88 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  42.46 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  42.46 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  41.18 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.69 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  37.88 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  35.11 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  38.71 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  38.71 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  39.34 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  36.27 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  35.23 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  38.17 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  38.38 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  34.2 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  38.62 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  36.26 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  35.06 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.72 
 
 		 243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.8 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  32.02 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.53 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  34.83 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  36.67 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  31.71 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  31.41 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  33.87 
 
 		 272 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  37.36 
 
 		 237 aa  98.6  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  31.25 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  28.1 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  28.9 
 
 		 303 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  32.09 
 
 		 297 aa  90.9  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  36.02 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  30.27 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  26.63 
 
 		 272 aa  89  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  31.07 
 
 		 259 aa  88.6  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.9 
 
 		 301 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  29.5 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  30.58 
 
 		 259 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  27.69 
 
 		 233 aa  85.9  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  32.77 
 
 		 249 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  35.8 
 
 		 248 aa  85.9  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  30.58 
 
 		 259 aa  84.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  35 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  29.61 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  34.27 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  27.93 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  31.55 
 
 		 263 aa  81.3  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.09 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  32.43 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.33 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  28.28 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  28.12 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  32.18 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  30.95 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.23 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  26.32 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  31.58 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.64 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  31.4 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  29.76 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  28.72 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  30 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.34 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  25.95 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  29.41 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  27.59 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  32.96 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  30.41 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  30.37 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.76 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30.95 
 
 		 271 aa  72  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  27.68 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  28.57 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  29.31 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  30.39 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  31.74 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  25.14 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  29.27 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  30.95 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  33.75 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  30.37 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  31.44 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.63 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>